Ausgebildet wurde er bei 1860 München, seine ersten Bundesligaspiele absolvierte er beim VfL Wolfsburg. Zu Beginn der Saison 2011/12 wechselte Fabian Johnson nun zu 1899 Hoffenheim. Im Kraichgau will der 23-Jährige „den nächsten Schritt machen“, wie es Manager Ernst Tanner zum Ausdruck brachte. Bereits in den ersten Pflichtspielen deutete der Juniorennationalspieler sein Können und seine Vielseitigkeit an. Beim ersten Pflichtspiel der Saison netzte Johnson auch prompt ein. Beim Erstrundenmatch im DFB-Pokal brachte er mit seinem Treffer zum 3:1 gegen Windeck 1899 endgültig auf die Siegerstraße.